Wenn in den Einstellungen von Skype einfach nur „Virtual Device“ statt des PulseAudio-Servers aufgeführt wird, ist die 32bit pulseaudio Library nicht installiert. Ein einfaches
sudo apt-get install libpulse0:i386
wirkt Wunder. Danach Skype beenden
killall -9 skype
und wieder starten. Funktioniert es jetzt immer noch nicht, dann muss mit Pavucontrol der Mikrofoneingang noch angeschalten werden. Das hat Microsoft hier dokumentiert.